○NHK
○東宝
○GAINAX
GAINAXは版権を持っていません。
考察
著作者人格権（公表権、氏名表示権及、同一性保持権）は譲渡することはできませんので、正規の方法によって出されているナディアの作品には「©NHK 東宝 1989」という記入があるはずですが、「実演」「レコード制作」「放送・有線送信権」「録音・録画」「貸与権・報酬請求権」「二次使用請求権」などは譲渡が可能です。従って、著作権違反は親告罪なので権利を持っている人に訴を起こしてもらわないと、権利侵害で訴えることは出来ないのです。
が、「公表権」「同一性保持権」はもとの著作者にあり、譲与・相続できないことになっていますので、今回の場合、訴訟を起こすことになれば、NHKと東宝に訴えればよいかと思われます。
映画の著作権は、制作者に帰属することになっています。GAINAXはNHKの下請けのような形でこのアニメを作ったわけですので、映画に準ずるテレビアニメ「ふしぎの海のナディア」の著作権はGAINAXには無いわけです。